GraphPad Prism · 2024年10月22日

50% 是什么?IC50 和 EC50 究竟是如何定义的?


IC50 和 EC50 的概念是药理学的基础。EC50 是药物产生半最大反应时的浓度。IC50 是抑制剂反应(或结合)减少一半时的浓度。

看起来很简单。但是,当您实际去拟合数据以确定这些值时,会存在一些复杂性和歧义。

本文的其余部分是关于 IC50(I 代表抑制,代表向下倾斜的剂量反应曲线)。所有这些想法都可以应用于刺激曲线和 EC50(E 代表有效)。当你看这些图时,只需倒立即可。

理想的情况

此图显示了一种理想情况:

绿色符号表示使用对照进行的测量。左侧的符号(空白)没有抑制剂,因此定义为“100%”。右侧的符号存在最大浓度的标准抑制剂,因此定义为“0%”。实验剂量反应曲线的数据(红点)一直延伸到两个对照值之间。

拟合此曲线时,您需要决定如何拟合曲线的顶部平台。您有三种选择:

  • 仅拟合数据,忽略空白对照值。
  • 对空白对照值取平均值,并将参数Top设置为等于空白平均值的常数值。
  • 输入空白值,就好像它们是剂量反应曲线的一部分一样。只需输入一个低剂量,可能是 10 -10或 10 -11。您不能输入零​​,因为零在对数刻度上没有定义。

这些方法中的任何一种的结果都将非常相似,因为数据形成完整的剂量 – 反应曲线,具有清晰的顶部平台,与空白无法区分。我更喜欢第三种方法,因为它分析了所有数据,但这并不是一个强烈的偏好。

同样,有三种方法可以处理底部平台:仅拟合数据,将 Bottom 设置为等于 NS 对照平均值的常数,并将 NS 对照放入拟合中,就好像它们是非常高浓度的抑制剂一样。

这是理想的情况。IC50 的含义没有歧义。

IC50 可以用两种方式定义的情况

该图显示了一种不寻常的情况,即抑制曲线稳定在远高于高浓度标准药物定义的对照值 (NS) 之上。这导致了 IC50 的替代定义。

显然,单个值无法概括这样的曲线。您至少需要两个值,一个用于量化曲线的中间值(药物的效力),另一个用于量化曲线的低度(药物的最大效果)。

上图显示了 IC50 的两个定义。

相对 IC50 是迄今为止最常见的定义,通常省略形容词相对。它是使曲线下降到曲线顶部和底部平台之间的中间点所需的浓度。在 IC50 的这个定义中,NS 值完全被忽略了。该定义是激动剂和拮抗剂相互作用的经典药理学分析的基础。在适当考虑生物系统和相互作用配体的浓度的情况下,估计的 Kd 值通常可以从以这种方式定义的 IC50 值得出(对于下面提到的“所谓的绝对 IC50”,情况并非如此)。

在空白值和 NS 值之间引发响应的浓度有时称为绝对 IC50,水平虚线表示如何定义 100% 和 0%,然后定义 50%。这个术语并不完全标准。由于该值不能量化药物的效力,因此国际药理学联合会受体命名委员会 (1) 的作者认为绝对 IC50 (和该术语) 的概念没有用 (R. Neubig,个人通信)。我同意。

该概念(但不是术语“绝对 IC50”)用于量化减缓细胞生长的药物。缩写 GI50 用于我们这里所说的绝对 IC50。环境保护署 (EPA) 也使用它来评估内分泌干扰物(附录 A)。他们使用术语 IC50 来指代绝对 IC50,使用术语 EC50 来指代相对 IC50。他们不使用术语 relative 和 absolute

如果您真的想使用绝对 IC50,以下是拟合曲线以找到它的说明

剂量-反应曲线不完整

任何通过对上图中的数据拟合曲线来确定 IC50 的尝试都是无用的。曲线拟合程序可能能够将剂量-反应曲线拟合到数据,也可能不能。但如果曲线拟合,则 IC50 的值可能毫无意义,并且具有非常宽的置信区间。数据根本不会形成顶部平台(定义 100)或底部平台(定义 0)。如果数据没有定义 100 或 0,那么 50 也是未定义的,IC50 也是如此。

如果您还具有定义 100 和 0 的控制值,则可以轻松拟合曲线。下面的曲线是通过拟合剂量反应曲线创建的,但将 Top 平台限制为等于 Blanks 值的平均值的常数值,以及 Bottom 平台等于 NS 值的平均值。

只有当您假设较高浓度的抑制剂最终会抑制至 NS 值时,以这种方式拟合的 IC50 值才有意义。这是一个无法用手头数据检验的假设。

相对 IC50 和绝对 IC50 之间的区别并不真正适用于这些数据。由于数据未定义底部平台,因此必须相对于 NS 对照值定义 IC50。

拟合归一化数据

从上面的所有示例中可以看出,没有必要将数据标准化以从 100% 下降到 0%。您可以使用自然单位的数据拟合曲线。一个常见的错误是假设拟合剂量-反应曲线需要首先对数据进行归一化。

如果您选择对数据进行归一化,则必须仔细考虑(并在论文的方法部分记录)如何定义 100% 和 0%。您可以使用三种策略:

  • 从外部控件(上图中的 Blank 和 NS)。由于这些值非常重要,因此请考虑使用比用于实验其余部分更多的重复来测量这些对照。
  • 来自极低和非常高浓度的供试物质。
  • 来自非线性回归的高原。首先拟合曲线,然后使用 Top 和 Bottom 平台的最佳拟合值对数据进行归一化。

如果您拟合标准化数据,您可能希望 Prism 强制曲线从 100 下降到 0。除非你告诉它,否则它不会知道这样做。不要犯一些常见的错误,即对数据进行归一化,但不将曲线从 100 限制到 0。您可以通过两种方式约束曲线:

  • 选择适应规范化模型。Prism 中内置的归一化模型始终介于 0 和 100 之间。
  • 使用更通用的模型,转到 Constrain 选项卡,并将 Bottom 设置为常量值 0.0,将 Top 设置为常量值 100.0。

总结

IC50(或 EC50)的概念有点模棱两可,除非您明确指定哪些值定义 100% 和 0%。

参考

1. R. R. Neubig et al. 国际药理学联合会受体命名和药物分类委员会。XXXVIII. 定量药理学术语和符号的更新。Pharmacol Rev (2003),第 55 卷第 4 期,第 597-606 页

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