FlowJo 的真正强大之处在于它能够批量分析和输出多个文件。
批处理，简单来说，就是创建一个任务列表，将它们放入一个队列中，然后将它们发送到计算机的 CPU 中按顺序进行处理。在 FlowJo 中，它可以转化为简单的用户手势，可以一遍又一遍地重复（例如将门拖到一组样本中），或者像为相似数据的新集合应用整个分析模板（门/表/布局）之类的复杂操作。
批处理有两个主要优点：一致性（每次迭代都与上一次相同）和速度（无需等待队列中的下一个动作，它是自动完成的）。
计算机非常适合重复任务。FlowJo 在批处理中利用了这一点。只需使用门控方案、统计数据或图形布局设置原型样本，然后告诉 FlowJo 将该原型应用于特定组或所有样本。
FlowJo 通过三种方式结合批处理来帮助您在整个分析过程中节省时间：
大多数批处理操作都是通过拖放或单击几下鼠标来启动的。
- 将门和/或统计数据从一个样本拖放到工作区中的组或所有样本 组。只需将分析树拖到组中即可。它们附加到组本身，然后附加到属于该组的每个样本（假设分析对该样本有效）。通过使用这些类型的组分析，您可以确保对所有样品进行相同的分析。当您更改组的分析版本（通过将新版本的门拖到组上）时，属于该组的所有样本都将自动更新为新副本（具有这种门的“特殊”版本的样本除外）。
- 在表编辑器 中为样品组或所有样品生成统计表。使用表格编辑器，您可以指定希望为每个样本收集的统计信息类型。然后为当前组创建表；FlowJo 允许您将表格保存到文件 （您可以将其导出到电子表格中）、剪贴板（因此您可以将其直接复制到电子表格中）或打印出来。此外，FlowJo 将保存表格并打开您最喜欢的电子表格程序并将表格复制到该程序中–只需单击一下即可！表定义与工作区一起保存，以便您将来可以再次使用它们。单击此处 以获取有关表编辑器中的批处理的更多信息。
- 从Layout Editor（布局编辑器）中的一个原型样本生成多个样本的布局和图形报告。布局编辑器允许您在绘图板上排列多个图形。然后将此图形布局应用于当前组中的一系列样本；结果可以保存到磁盘（.jpg、.png 等格式）、复制到其他应用程序（如 Open Office）或打印。单击此处 了解有关布局编辑器中的批处理的更多信息。
