v10 中的 JO 文件
版本 10 可以打开在版本 9 中创建的 .jo 文件
在 FlowJo 版本 9 中创建的工作区文件的扩展名为 .jo，相当于版本 10 中的 .wsp 文件。版本 9 是我们软件的最后一个仅限 Mac 的版本，而版本 10 与平台无关。从版本 10.8.0 开始，并在版本 10.8.1 中进行了改进，现在可以在版本 10 中直接打开 .jo 文件。有一些提示可以提高此功能的兼容性和限制。
使用版本 9.9.6
版本 10 已更新为读取 9.9.6 的输出，该版本于 2017 年 8 月发布，可在此处下载。如果您拥有激活任何版本9 FlowJo 的许可证，则这是一个免费更新。
要在 v10 中打开一个 .jo 文件…
…只需将其拖动到打开的 V10 工作区或使用 File： Open。您将获得完整的门控层次结构，包括统计信息、包含文件分配的组、关联的数据文件、表定义和布局页面。v9 中有一些工具从未添加到 v10 中，但不受支持，系绳门(tether gates )就是一个例子。布局和 FlowJo 创建的补偿矩阵需要特别注意……
布局不会直接导入
不幸的是，实时布局超出了我们可以在版本之间转换的范围。我们的建议是将版本 9 中的重要布局导出为图形文件，并根据需要将它们导入到 v10 中。它们不可修改，因此对于任何更改，都需要在 v10 中重新创建布局。
在 v9 中创建的 comp 矩阵需要单独导入
采集定义的矩阵记录在 FCS 文件中，在版本 10 中打开 .jo 文件时无需进一步操作即可导入。但是，在 FlowJo 中创建的矩阵不直接与 fcs 文件关联，需要另存为 .mtx 文件，然后拖动到版本 10 工作区中。为此，请执行以下操作：
在版本 9 中将您选择的矩阵保存在平台菜单中： Edit/Save Matrix:
版本 9 没有显式添加 .mtx 扩展名，因此请在保存对话框中键入它，或者在生成的文件上更改扩展名。
您可以通过将此矩阵拖放到示例文件或组上，或者使用矩阵编辑器中的导入矩阵按钮，将此矩阵添加到版本 10 工作区。单击 + 按钮，然后选择“从文件”并导航到保存的 .mtx 文件。加快速度的一种方法是使用下面提到的批量转换插件。
批量转换插件
批量转换器插件允许您指向一个或多个文件夹.Jo 文件，并创建名称与 .jo 文件名称匹配的 .wsp 文件，所有 .jo 文件和任何矩阵的 .mtx 文件位于同一位置。
您可以从 FlowJo Exchange 下载批量 jo 文件转换器，并使用 FlowJo 首选项指向它所在的位置来安装它。
要使用批量转换器，您需要选择一个文件，任何文件，以取消插件下拉列表中列出的插件的灰色，然后从插件下拉菜单中选择 FlowJoV9BulkConverter。它会要求您选择要在其上运行的一个或多个文件夹：
选择该文件夹后，插件将在 v10 中打开每个 .jo 文件，保存它，将其找到的任何矩阵导出为 .mtx，然后关闭工作区。结果是每个 .jo 文件旁边的 .wsp 文件。
请注意： 批量转换器将为文件夹中的所有矩阵写入一个 .mtx 文件，因此每个带有 comp 矩阵的 jo 文件都将参与此列表，并且具有相同名称的矩阵将相互覆盖。为了避免这种情况，您可以将 jo 文件放入单独的子文件夹中，或者将矩阵重命名为唯一。对于采集定义的矩阵也是如此，但可能不是问题，因为 .fcs 文件本身包含这些矩阵，这意味着它们将自动包含在 .wsp 文件中，您不必将它们拖入。您可以简单地删除不需要的矩阵。
